Для штурма столицы Восточной Пруссии собралась группировка советских войск численностью 137 тысяч человек, более 5 тысяч орудий, 500 танков и самоходно-артиллерийских установок. Кенигсберг и подступы к нему были тщательно отсняты с воздуха. По оценке советской разведки, гарнизон города составлял около 60 тысяч человек, но, как вскоре выяснилось, силы защитников были существенно недооценены. План командования Красной Армии предусматривал удар по Кенигсбергу с юга, поскольку наибольшее внимание немцы уделяли северному фронту обороны города.
Здесь пролегала жизненно важная для крепости трасса к порту Пиллау на Земландском полуострове, через который противник получал боеприпасы, горючее и другие предметы снабжения. Забота о сохранении этой связки с Пиллау перевешивала для немецкого командования опасности оголения южного фронта обороны Кенигсберга.
В ночь на 6 апреля, за считаные часы перед началом штурма Кенигсберга, саперы напряженно проделывали проходы в минных полях и заграждениях противника, расчищая подступы к фортам.
Штурм Кенигсберга начался утром 6 апреля. Тяжелая артиллерия сосредоточила огонь на фортах, находившихся на направлении главных ударов. После трехчасовой артподготовки в боевых порядках пехоты к фортам выдвинулись тяжелые самоходные орудия ИСУ-152 в готовности подавлять огневые средства фортов, но форты молчали. Советские танки и пехота, прорвав оборону немцев в промежутках между фортами, стали продвигаться к городу.
Ключом к успеху операции стало глубокое эшелонирование инженерно-саперных частей, которые действовали тремя эшелонами. Первый эшелон состоял из войсковых саперов и саперов-штурмовиков. Они продвигались в боевых порядках наступающих войск и выполняли задачи инженерной разведки, участвовали в штурмовых действиях, обеспечивали войска проходами в заграждениях противника и пропускали артиллерию, другую боевую технику через заграждения и водные преграды.
Кроме этого, инженерно-саперные части обеспечивали боевые действия танков, закрепляли захваченные объекты и прикрывали внешние фланги инженерными средствами.
Корпусные, а также приданные армейские и фронтовые инженерные части второго эшелона следовали непосредственно за боевыми порядками и занимались разминированием маршрутов, расчисткой проездов в препятствиях, производили необходимые дорожно-мостовые работы.